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在臨床上，先天性巨結(jié)腸一旦診斷明確，如果患者沒有明顯的手術(shù)禁忌，那么這時候就應(yīng)該及時的進(jìn)行手術(shù)治療為好。

而且，在手術(shù)治療之前，可以對患者進(jìn)行一些擴(kuò)肛、鹽水灌腸、開塞露塞肛、補(bǔ)充營養(yǎng)等治療，以緩解患者的腹脹，維持好患者的營養(yǎng)狀態(tài)，而且，手術(shù)的時候，要有良好的麻醉，手術(shù)要求切除缺乏神經(jīng)節(jié)細(xì)胞的腸段和明顯擴(kuò)張肥厚、神經(jīng)節(jié)細(xì)胞變性的近端結(jié)腸，這樣的話，才能夠解除功能性腸梗阻。

而且，對于必須要進(jìn)行手術(shù)治療，但是患者的病情過于嚴(yán)重，那么這時候，可以先行腸造口，以后再進(jìn)行根治性的手術(shù)治療。所以，先天性巨結(jié)腸的患者，就診的時間一定要及時，這樣的話，才有利于患者的治療進(jìn)行。