手術(shù)修補(bǔ)是主要的治療方法，手術(shù)損傷者應(yīng)該術(shù)中立即修補(bǔ)。手術(shù)的方式可以經(jīng)陰道、經(jīng)直腸或者是開腹途徑完成。瘺的修補(bǔ)，手術(shù)方式的選擇，主要是根據(jù)瘺管形成的病因、位置及大小，是否存在多個(gè)瘺管，以及醫(yī)生的手術(shù)經(jīng)驗(yàn)和技巧。
瘺修補(bǔ)術(shù)主要是切除瘺管，游離周圍組織后進(jìn)行多層縫合。高位巨大直腸陰道瘺者，合并尿瘺的，前次手術(shù)失敗，陰道瘢痕嚴(yán)重者，可以先行暫時(shí)性的乙狀結(jié)腸造瘺，之后再行修補(bǔ)手術(shù)。糞瘺的手術(shù)應(yīng)掌握手術(shù)時(shí)機(jī)，先天性糞瘺應(yīng)該在患者十五歲左右月經(jīng)來(lái)潮后再行手術(shù)。過早的手術(shù)容易造成陰道狹窄，壓迫壞死性的糞瘺應(yīng)等待三到六個(gè)月以后，再行手術(shù)修補(bǔ)。
術(shù)前的嚴(yán)格腸道準(zhǔn)備，同時(shí)可以口服腸道抗生素。術(shù)后給予靜脈高營(yíng)養(yǎng)，同時(shí)口服腸蠕動(dòng)抑制藥物，5-7天以后，逐漸從進(jìn)食進(jìn)水過度飲食，保持會(huì)陰清潔。
