再生障礙性貧血最主要的診斷依據是血常規(guī),骨髓涂片以及骨髓活檢,血常規(guī)當中,可以見到患者可以出現三系血細胞的減少。而骨髓涂片可以見到骨髓外觀有大量的油脂,骨髓增生減低或者是重度的減低,粒系統可以見到以中性分葉核粒細胞為主,中,晚幼稚粒細胞以及其他的幼稚粒細胞比較的少見,淋巴細胞比例可以出現增高。紅細胞系統多是減少的,以晚幼紅細胞為主,而且晚幼紅細胞可以出現炭核樣的改變。巨核細胞和血小板少見,漿細胞,組織嗜堿細胞出現增多,并且可以見到非造血細胞團。
骨髓活檢可以見到造血成分明顯減少,除此之外,網織紅細胞和粒細胞通常也減少,所以通過以上這些輔助檢查可以診斷再生障礙性貧血。