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肛瘺手術(shù)理論上來說是沒有什么危險性的，但是肛瘺手術(shù)要常常進行腰部麻醉或者是全麻，任何麻醉都是會有不良反應(yīng)或者并發(fā)癥，包括肛瘺手術(shù)的麻醉同樣也是。

肛瘺手術(shù)正常情況下并沒有很大的危險性，但是如果患者的肛瘺屬于多發(fā)的復(fù)雜性的高危的肛瘺，這個就對術(shù)者的水平有很高的要求，因為如果術(shù)者的水平不高，一次手術(shù)不能愈合，二次手術(shù)會對肛周的這種肌肉組織造成更大的傷害，第三次的時候，以前的切口會變硬，肛門功能可能會受到損失，這也就是唯一對患者可能造成傷害的地方，就是肛門括約肌影響到肛門功能的發(fā)揮。

在臨床上，如果單純性的肛瘺一般比較簡單，手術(shù)過程快，手術(shù)的愈合時間也比較短，如果是復(fù)雜性的或者高危性的肛瘺，一定要找正規(guī)的醫(yī)院，找有經(jīng)驗的醫(yī)生，對肛瘺進行判斷討論，然后盡量的一次性的將其處理好，因為一次處理不好，二次更麻煩。