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結(jié)腸鏡作全結(jié)腸及回腸末端檢查。病變呈節(jié)段性、非對(duì)稱性分布，見(jiàn)阿弗他潰瘍或縱行潰瘍、鵝卵石樣改變，腸腔狹窄或腸壁僵硬，炎性息肉，病變之間黏膜外觀正常。

因?yàn)榭肆_恩病病變累及范圍廣、為腸壁全層性炎癥，故其診斷往往需要X線與結(jié)腸鏡檢查的相互配合。結(jié)腸鏡檢查直視下觀察病變，對(duì)該病的早期識(shí)別、病變特征的判斷、病變范圍及嚴(yán)重程度的估計(jì)較為準(zhǔn)確，且可取活檢，但只能觀察至回腸末端，遇腸腔狹窄或腸粘連時(shí)觀察范圍會(huì)進(jìn)一步受限。

X線檢查，可觀察全胃腸道，顯示腸壁及腸壁外病變，故可與結(jié)腸鏡互補(bǔ)，特別是在小腸病變的性質(zhì)、部位和范圍的確定上仍然是目前最為常用的方法。近年發(fā)明的膠囊內(nèi)鏡、雙氣囊小腸鏡等技術(shù)提高了對(duì)小腸病變?cè)\斷的準(zhǔn)確性，有助提高克羅恩病的診斷水平。